Nel 2014, sotto la gestione di Menitez, Hamsik diventa capitano del Napoli, a causa della cessione di Paolo Cannavaro. Nel maggio di quell’anno regala la seconda Coppa Italia al Napoli con un 3-1 in finale contro la Fiorentina. Il 22 dicembre conquista la Supercoppa Italiana vincendo contro la Juventus.

Il 25 aprile 2016 raggiunge 400 presenze col Napoli. Il 6 maggio 2018 taglia il traguardo dei 100 gol nella massima serie del campionato italiano, superando invece Maradona qualche gara dopo. Hamsik chiude la sua carriera al Napoli nel 2019 con 121 gol realizzati: è il miglior marcatore della storia del Napoli, ma verrà raggiunto da Mertens un anno e mezzo dopo. 

A partire da febbraio 2019 Hamsik è un giocatore del Dalian Yifang, club cinese. Nel 2021 si svincola  per firmare con il Göteborg, in Svezia. A sorpresa, l’8 giugno, ha firmato per i turchi del Trabzonspor, squadra nella quale milita tutt’ora.

Con la nazionale slovacca ha collezionato 126 presenze e 26 gol fatti. Ha partecipato ad un mondiale (2014) e due europei (2016, 2020).